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Inoltre l'efficienza del sistema mucociliare è largamente dipendente dalle caratteristiche fisico-chimiche del muco. In caso di secrezione insufficiente, il battito ciliare è bloccato, nel caso di secrezione eccessiva , il movimento ciliare è rallentato.
L'aumentata secrezione di muco, deriva dal contatto della mucosa con le noxae patogene già elencate ed è spesso associata all'ostruzione nasale rendendo il neonato, il bambino e l'adulto, incapace di respirare attraverso il naso. L'organismo compensa con la respirazione orale, ma l'ostruzione nasale può causare complicazioni per la stretta vicinanza con l'orecchio medio e i seni paranasali, dando luogo a otiti medie e sinusiti. Inoltre, la respirazione orale e il mancato condizionamento dell'aria inspirata, possono causare: faringite (mal di gola), laringite (abbassamento di voce), tracheite (tosse) e bronchite.
Normalmente la liberazione delle fosse nasali avviene attraverso la manovra del soffiamento, cioè si espira forzatamente attraverso il naso. Spesso, o in condizioni particolari, il soffiamento risulta insufficiente o inopportuno per rimuovere le secrezioni nasali, sia per la conformazione irregolare delle fosse nasali, sia per la viscosità delle secrezioni mucopurulente, purulente o rapprese in croste, sia per la presenza dell'edema che riduce lo spazio interno delle fosse nasali.
Inoltre, in particolari circostanze come nel decorso post-operatorio per interventi maxillo-facciali, nel neonato, nel bambino è impossibile ricorrere a tale manovra, per cui bisogna intervenire dall'esterno per rimuovere il muco.